Logo EYOF Skopje 2025 zostało zaprojektowane jako zunifikowana kompozycja, zawierająca istotę dwóch ikonicznych symboli: Kamiennego Mostu, najbardziej rozpoznawalnego punktu orientacyjnego Skopje oraz słońca, zainspirowanego flagą Macedonii Północnej.
Elementy te są stylizowane i uzupełniane sylwetką sportowca, reprezentującego XVIII Letni Olimpijski Festiwal Młodzieży Europy Skopje 2025.
Kolory logo zostały starannie dobrane, aby pasowały do pięciu kół olimpijskich, oddając ducha olimpizmu. Jako fundament i inspirację dla identyfikacji wizualnej włączono tradycyjny haft macedoński, będący istotną częścią dekoracji tradycyjnego stroju macedońskiego.
Niektóre elementy zostały zmodernizowane i stylizowane, a dodatkowe szczegóły zostały wprowadzone, aby odzwierciedlić sporty prezentowane na wydarzeniu i kluczowe miejsca w Skopje.